CEN/TS 17303:2019
Foodstuffs - DNA barcoding of fish and fish products using defined mitochondrial cytochrome b and cytochrome c oxidase I gene segments
| Fecha edición: |
2024-09-18
Anulada
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| Fecha cancelación: | 2024-09-18 |
| Idiomas disponibles: | Francés, Alemán, Inglés |
| Resumen: | Le présent document décrit un mode opératoire d’identification au niveau du gène ou de l’espèce des poissons individuels et des filets de poisson.
L’identification des espèces de poisson s’effectue par amplification par réaction de polymérisation en chaîne (PCR : Polymerase Chain Reaction) d’un segment du gène du cytochrome b mitochondrial (cytb) 1], du gène du cytochrome c oxydase I (cox1 ou COI) [2], [3] ou des deux, suivie d’un séquençage des produits de la PCR et d’une comparaison des séquences aux entrées de bases de données [4], [5]. Cette méthodologie permet l’identification d’un grand nombre d’espèces de poisson à forte importance commerciale.
Le choix de l’utilisation de segments de gènes de cytb ou de cox1 ou des deux pour l’identification du poisson dépend de l’espèce de poisson déclarée, de la facilité d’application de la méthode de la PCR à l’espèce de poisson considérée et de la disponibilité des séquences de comparaison dans les bases de données publiques.
Cette méthode a été validée avec succès sur des filets de poisson cru mais des expériences menées en laboratoire montrent qu’elle est également applicable à des échantillons après transformation (fumage à froid ou à chaud, salage, congélation, cuisson, friture, etc.).
Le présent document est de manière générale inadapté à l’analyse d’aliments hautement transformés comme les poissons en conserve dont l’ADN est fortement dégradé et dont les longueurs des fragments se révèlent insuffisantes pour l’amplification des cibles. En outre, la méthode présentée ici n’est pas applicable aux produits complexes à base de poisson qui mélangent deux espèces de poissons et plus. This document describes a procedure for the identification of single fish and fish fillets to the level of genus or species. The identification of fish species is carried out by PCR amplification of either a segment of the mitochondrial cytochrome b gene (cytb) or the cytochrome c oxidase I gene (cox1, syn COI) or both, followed by sequencing of the PCR products and subsequent sequence comparison with entries in databases. The methodology allows the identification of a large number of commercially important fish species. The decision whether the cytb or cox1 gene segment or both are used for fish identification depends on the declared fish species, the applicability of the PCR method for the fish species and the availability of comparative sequences in the public databases. This method has been successfully validated on raw fish fillets, however, laboratory experience is available that it can also be applied to processed, e.g. cold smoked, hot smoked, salted, frozen, cooked, fried, deep-fried samples. This document is usually unsuitable for the analysis of highly processed foods, e.g. tins of fish, with highly degraded DNA where the fragment lengths are not sufficient for amplification of the targets. Furthermore, it is not applicable for complex fish products containing mixtures of two or more fish species. Dieses Dokument legt ein Verfahren für die Identifizierung von Einzelfischen oder Fischfilets auf Gattungs- oder Speziesebene fest. Die Identifizierung der Fischspezies erfolgt durch PCR-Amplifikation entweder eines Segments des mitochondrialen Cytochrom-b-Gens (cytb) [1] oder des Cytochrom-c-Oxidase-I-Gens (cox1, syn COI) [2], [3] - oder von beiden, gefolgt von der Sequenzierung der PCR-Produkte und einem anschließenden Datenbankabgleich der Sequenzen [4], [5]. Diese Methodik erlaubt die Identifizierung einer großen Zahl kommerziell wichtiger Fischspezies. Die Entscheidung, ob der cytb- oder der cox1-Genabschnitt oder beide für die Fischidentifizierung herangezogen werden, hängt von der deklarierten Fischspezies, der Anwendbarkeit des PCR-Verfahrens für die Fischspezies und der Verfügbarkeit vergleichbarer Sequenzen in den öffentlichen Datenbanken ab. Dieses Verfahren wurde erfolgreich an rohen Fischfilets validiert, Laborerfahrungen zeigen jedoch, dass dieses Verfahren auch an verarbeiteten Proben wie z. B. kalt- und heißgeräucherten, gesalzenen, tiefgefrorenen, gekochten, gebratenen und frittierten Proben angewendet werden kann. Dieses Dokument ist in der Regel ungeeignet für die Untersuchung stark verarbeiteter Lebensmittel - z. B. Fischkonserven mit stark degradierter DNA, bei denen die Fragmentlängen nicht für eine Amplifizierung der Zielsequenzen ausreichen. Außerdem ist es nicht anwendbar auf zusammengesetzte Fischprodukte, die aus mehr als einer Fischspezies bestehen. |
| ICS: | 67.120.30 - Pescados y productos de la pesca |
| CTN: | CEN/TC 460 - 2565430 |
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Anulaciones Normas |
Es anulada por prEN ISO 17174 |
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