This document specifies a method for the taxonomic identification of a single bivalve or piece of bivalve to the genus or species level using DNA barcoding. It allows the identification of a large number of commercially important bivalve species.
This method was validated on raw mussels. Laboratory experience indicates additional applicability to processed bivalve products, e.g. cold smoked, hot smoked, salted, frozen, cooked, fried, and deep-fried samples.
The described method is usually unsuitable for the analysis of highly processed foods, e.g. tins of mussels, with highly degraded DNA where the fragment lengths are not sufficient for amplification of the target. Furthermore, it is not applicable for complex seafood products containing mixtures of two or more bivalve species.
The identification of bivalve species is carried out by PCR amplification of a segment of the mitochondrial 16S rRNA gene, followed by sequencing of the PCR products and subsequent sequence comparison with entries in databases.
Le présent document spécifie une méthode d’identification taxonomique d’un bivalve ou d’un morceau de bivalve jusqu’au niveau du genre ou de l’espèce par codage à barres de l’ADN. Elle permet d'identifier un grand nombre d’espèces de bivalves importantes sur le plan commercial.
Cette méthode a été validée sur des moules crues. Les expériences en laboratoire montrent qu’elle est également applicable aux produits transformés à base de bivalves, par exemple les échantillons fumés à froid, fumés à chaud, salés, congelés, cuits, frits, frits dans l’huile.
D’une façon générale, la présente méthode ne convient pas à l’analyse d’aliments hautement transformés, par exemple les moules en conserve, contenant de l’ADN fortement dégradé dans lequel les longueurs de fragment ne sont pas suffisantes pour amplifier la cible. Par ailleurs, elle n’est pas applicable aux produits complexes à base de fruits de mer contenant des mélanges d’au moins deux espèces de bivalves.
L’identification de l’espèce de bivalve est effectuée par amplification PCR d’un segment du gène de l’ARNr 16S mitochondrial, suivie du séquençage des produits de PCR puis de la comparaison des séquences avec les entrées présentes dans les bases de données.
Dieses Dokument legt ein Verfahren zur taxonomischen Identifizierung einer einzelnen Muschel oder eines Muschelstücks auf Gattungs- oder Artebene mittels DNA-Barcoding fest. Es ermöglicht die Identifizierung einer großen Anzahl kommerziell bedeutender Muschelarten.
Dieses Verfahren wurde an rohen Muscheln validiert. Laborerfahrungen deuten auf eine zusätzliche Anwendbarkeit auf verarbeitete Muschelerzeugnisse hin, wie z. B. kalt- und heißgeräucherte, gesalzene, tiefgefrorene, gekochte, gebratene und frittierte Proben.
Für die Untersuchung stark verarbeiteter Lebensmittel, wie z. B. Muschelkonserven, mit stark degradierter DNA, bei denen die Fragmentlängen nicht für eine Amplifikation der Zielsequenz ausreichen, ist das beschriebene Verfahren in der Regel nicht geeignet. Außerdem ist es nicht anwendbar auf komplexe Meeresfrüchteprodukte, die mehr als eine Muschelart enthalten.
Die Identifizierung der Muschelart erfolgt durch PCR-Amplifikation eines Segments des mitochondrialen 16S rRNA-Gens, gefolgt von der Sequenzierung der PCR-Produkte und einem anschließenden Datenbankabgleich der Sequenzen.